Segundo o parecer 1300/01 do Conselho Nacional de Educação (CNE) e Câmara de Superior de Educação (CSE), o perfil do formando em Farmácia deve ter as seguintes características: formação humanista, crítica, reflexiva e generalista para atuar em todos os níveis de atenção à saúde, com base no rigor ético e científico. Também deve estar capacitado ao exercício de atividades referentes aos fármacos, aos medicamentos e à assistência farmacêutica, e de forma integrada às análises clínicas e toxicológicas, aos cosméticos e aos alimentos, em prol do cuidado à saúde do indivíduo, da família e da comunidade.

O curso de Bacharelado em Farmácia da UFSC tem um projeto pedagógico centrado no aluno como sujeito da aprendizagem e apoiado no professor como facilitador e mediador do processo ensino-aprendizagem, visando buscar a formação integral e adequada do estudante através de uma articulação entre o ensino, a pesquisa e a extensão/assistência. A formação do Farmacêutico egresso da UFSC deverá contemplar as necessidades sociais da saúde, a atenção integral da saúde no sistema regionalizado e hierarquizado de referência e contrarreferência e o trabalho em equipe, com ênfase no Sistema Único de Saúde (SUS). Os conteúdos desenvolvidos no curso, organizados em regime seriado semestral, contemplam as áreas de:

1. Ciências Exatas: incluindo-se aqui as abordagens, os processos e os métodos físicos, químicos, matemáticos e estatísticos como suporte às ciências farmacêuticas;
2. Ciências Biológicas e da Saúde: conteúdos de base moleculares e celulares dos processos normais e alterados, da estrutura e função dos tecidos, órgãos, sistemas, bem como processos bioquímicos, microbiológicos, imunológicos e genética molecular em todo desenvolvimento do processo saúde-doença;
3. Ciências Humanas e Sociais: conteúdos referentes às diversas dimensões da relação indivíduo/sociedade, contribuindo para a compreensão dos determinantes sociais, culturais, comportamentais, psicológicos, ecológicos, éticos e legais e conteúdos envolvendo a comunicação, a economia e gestão administrativa em nível individual e coletivo, como suporte à atividade farmacêutica;
4. Ciências Farmacêuticas: conteúdos relacionados aos estudos dos medicamentos no que se refere à pesquisa, desenvolvimento, formulação, produção, armazenamento e controle de qualidade de insumos, fármacos, medicamentos e cosméticos; farmacodinâmica, biodisponibilidade, farmacocinética, emprego terapêutico, farmacoepidemiologia, visando garantir as boas práticas de dispensação e a utilização racional; aqueles que fundamentam à atenção farmacêutica em nível individual e coletivo; conteúdos referentes ao diagnóstico clínico laboratorial e terapêutico e conteúdos da bromatologia, biossegurança e da toxicologia como suporte à assistência farmacêutica.